Mendeley初嘗試(1)

自從上週完成了兩篇paper的修改以後，手邊就只剩下一篇已經流浪了四年的陳年手稿。
因為實在不太想改不太好改，所以這幾天都在玩zotero這個文獻整理工具。

昨天再找paper的時候無意中看到除了zotero外，還有一個跨平台（win/linux/mac）的免費文獻軟體：mendeley。
所以今天從中午吃完飯以後就沉迷在這裡面了…金害…

先來談談mendeley吸引我的地方（參考官方說明網頁，功能依據我個人喜好度排列由高到低）：

1. Gather papers from everywhere：多重的文獻建檔方式。mendeley官網上面提供了一個"Import to mendeley"的bookmarklet，將之拖曳到書籤工具列後，日後在mendeley支援的網頁（參閱下圖）輕輕點擊一下就可以把文獻加入你的資料庫中。此外mendeley非常吸引我的一個亮點是它可以自動根據資料夾內容的變化新增文獻到資料庫中。舉例來說，如果你讓mendeley監視一個叫做thesis的資料夾，日後你在這個資料夾中新增文獻後（當然必須是pdf檔），mendeley就會從pdf檔中抓出文獻的標題、作者、期數等資訊新增到你的文獻資料庫，非常適合懶人一族！
2. Generate Bibliographies in Word and OpenOffice：輸出文獻到word或ooo裡面，一邊寫paper一邊添加文獻，最後一個按鍵就可以產生參考資料的清單。這可以節省我好多時間啊啊啊～不然每次手稿修改完以後都要花半小時到一小時檢查參考文獻是否與正文相符實在超累人的。輸出的文獻格式有許多選擇，對我最有用的APA格式當然包含在內。
3. Build your network of fellow researchers：以我自己來說，學校研究室、家裡、甚至是其他我可以用筆電工作的地方我都可能需要使用到文獻。所以只能存在單機上面的文獻資料庫是不符合我使用的。經由免費的註冊，mendeley就提供了一套很好的解決方案：不同電腦間的同步功能及一個免費的網頁資料庫。每次在單機上新增文獻後，使用者可以藉由同步功能更新網頁資料庫，之後就算換到其他的電腦上也可以經由同步功能更新其他電腦上的資料。此外，既然有網頁資料庫，一個人使用實在太浪費了，還可以跟好友共享文獻資料，避免重複建檔的麻煩。網頁資料庫的樣子大致如下：
4. Explore research trends and statistics：這個功能蠻有趣的，在登入mendeley網頁後，首先會看到的就是一個所謂dashboard的畫面。裡面有些有趣的統計資訊，例如在你選定的研究領域中大家最常引用的文獻是哪幾篇？或是有哪些大牌學者的文獻資料庫是最受歡迎的…感覺有時候可以挖到寶藏的感覺呢。
5. Collaborate, share and discover：這部份因為我沒找到人跟我一起使用mendeley，所以沒啥心得可以寫（其實是想偷懶，不知不覺寫好多了啊啊啊）。
6. Annotate PDFs：除了文獻的管理外，mendeley還可以讓你將pdf檔附加在每筆文獻的後面，方便隨時查閱。而且不只是查閱而已，你還可以在pdf檔案中螢光標示文字或添加註解。此外，在官網註冊一個帳號後可以免費取得500MB的空間，之後你可以選擇在將本機文獻同步到網頁上時是不是要同步上傳pdf檔。

其他當然還有很多讓人激賞的細節，但是我太久沒寫blog了，一次叫我寫這麼多還要抓圖傳圖實在太累了，敬請期待明天的續集吧。下一集裡面我會談談在初步體驗mendeley之後的感想，並且簡單的比較一下mendeley和zotero的優缺點。

應該怎樣問問題？

跟大家分享一篇不錯的文章：
意識型態咖啡:請教別人，但不要依賴別人 - 樂多日誌

文章裡面主要提到在問問題時，應該：

1. 先做好功課
2. 瞭解事情的成敗責任仍在自己
   

剛好這兩點我自己都有些感觸，就順便寫在這裡。

我有一位很愛問問題的學弟，碰巧呢，我是一個在自己知識/能力範圍很喜歡跟人討論問題的人，所以學弟經常跑來問我問題。
但有幾次，我在聽完他的問題以後覺得很不高興。那些問題大概會是這種樣子的：
「學長，我知道我翻書可以找到答案，但是我想說問你比較快。那個ooxx統計應該要怎樣跑…」
讓我生氣的是，如果你知道書上有答案，而且你手邊正巧有那本書，你為什麼不試著自己去找答案呢？
尤有甚者，你不是翻過書找不到答案才來問我。而是連翻都懶得翻，那我有什麼義務要幫你找出答案？

至於和「成敗責任」有關的那點，坦白說，我自己有時也會用「我之所以會…，是因為某某人建議/認為…」這種說法。但我這樣說的時候絕對不僅僅是因為我採用了某人的意見這麼簡單而已。
在influential tactics的研究中，有一種影響策略叫做"Upward Appeals"，意思是藉由訴諸權威意見去說服他人(The person seeks to persuade you that the request is approved by higher management, or appeals to higher management for assistance in gaining your compliance with the request;" Yukl & Falbe, 1990, p. 133)。
這樣的想法跟抱怨：「我所以這樣做，都是因為某某人跟我說可以這樣做」是完全不同的。我知道該負責任的人是我，這樣的說法只是一種手段，藉由借助權威者的意見去達到我想要的目的（例：投稿過程中答覆審稿人的評論意見）。
但很多人似乎混淆了手段和責任歸屬間的差異，這點是相當可惜的～

5 useful bookmarklets for your web browser

什麼是bookmarklet呢？異塵行者如是說：

我們只要像平常收藏書籤一樣，將「javascript連結」加入Firefox的「書籤工具列」，或是加入IE的「連結」（當然你也可以收藏到你想要的任何書籤資料夾中），即可完成書籤小程式的「安裝」。

一個好用的bookmarklet可以讓你的瀏覽經驗大幅提昇，這裡喬瑟夫就要介紹一些自己常用的bookmarklet。各位如果看了有興趣也可以試用看看，作法很簡單，以firefox為例，只要把我提供的bookmarklet標題拖曳到firefox的書籤工具列即可：

1. Diigolet
之前在「在任意網頁上畫筆記-並且保留它們！」這篇文章裡面曾經介紹過diigo的相關服務，當時喬瑟夫介紹的作法是安裝diigo bookmark and web annotations這個火狐套件。但是在升上3.5pre版後，這個套件就不相容了。但是diigo的畫重點功能說真的還不錯用，難道沒有別的辦法嗎？後來喬瑟夫發現了Diigolet這個bookmarklet，問題馬上迎刃而解！這也是bookmarklet的一大優點：不依賴特定瀏覽器、不受瀏覽器版本限制。
如果你有diigo帳號，在任何網頁點選diigolet後會在視窗上方出現一個工具列，你可以用它將目前網頁加入diigo網路書籤、畫重點、加上螢幕便利貼以便留下註解（以上兩項功能在關閉瀏覽器、重新連上網頁也能看得到，前提是要有diigo帳號並登入），以及其他diigo提供的功能。


2. FormTextResizer
有時候網頁上的文字輸入框實在是太小了，如果你有這種感觸，那FTR就是你的救星啦！在任意網頁點選FTR這個bookmarklet後，你就可以任意的縮放網頁中文字框的大小（喬瑟夫個人常在plurk時使用）。


3. Readability ＆ Readability 2
有沒有碰過一些網頁設計的花花綠綠，字體顏色還千奇百怪的？如果覺得看起來很吃力，這裡提供兩種解決方式，希望可以讓大家不要那麼辛苦。讓我們以最近被稱讚的紀宅網頁為例，假設（我一定要強調這兩個字，不然紀宅會唉唉叫）大家都覺得這個網頁的配色超鳥，字體很醜，如下圖：


輕輕按下Readability這個bookmarklet後，紀宅的網頁會變成黑體黃字高亮度顯示的下圖：


雖然有些電腦宅可能喜歡上面那種效果，但喬瑟夫個人比較喜歡走清爽路線的Readability 2（撥頭髮），如下圖所示：


4. BugMeNot
據說台灣網路的特色就是論壇多，也因此，常常在網路上找資料時會被搜尋引擎指引到一些論壇的文章或討論去。讓人討厭的地方來了：很多論壇要求你要註冊才可以看到論壇文章的內容。雖然論壇管理員可能會告訴你：

但是誰想要為了看篇文章就去註冊一個新帳號啊！這種時候請你跟我這樣作：猛力點擊BugMeNot這個bookmarklet，並且在新跳出來的分頁中找到該論壇的登入資訊：

當然這些資訊都是網友貢獻的，可能有用但也可能已經失效了，不過不管你是基於保護個人資料安全、或是（跟喬瑟夫一樣）懶得到處註冊，BugMeNot經常可以幫的上忙得。

5. Remove Bloat
很多時候我只是想靜靜的閱讀網頁上的資訊，但是網頁的主人會很熱情的跟我分享他鍾愛的音樂。有時是浪漫的鋼琴、有時是蔡腸的新歌、有時是布袋戲的口白…

但是我一點都不想聽這些啊啊啊～

（冷靜下來）雖然大部分的情況下可以用網頁上的stop鍵關掉背景音樂（但通常要找很久才找得到），但Remove Bloat可稱為是網頁內嵌多媒體的致命殺手！讓我們再次以跟宏都拉斯有著不解之緣的紀宅網頁作個範例。假定我被這個網頁背景音樂感動到痛哭流涕久久無法自已覺得人生在此刻停止也無所謂看到一生的經歷在眼前如走馬燈閃過好了（呼～），為了終止這樣的感動我想關掉音樂，所以我按下了Remove Bloat。
使用前：




使用後：


播放器就這樣硬生生的備砍掉了！萬歲！！


以上是今日的bookmarklet分享，也希望各位可以告訴喬瑟夫你是否知道有其他好用的書籤工具。謝謝收看。

2008JCR

昨晚丹尼斯學長提到2008年的Journal of Citation Reports (JCR)分數出來了，頓時噗浪上面的某個小小朋黨（噗浪官方用語，請參見「私密plurk、語系與選項」）就炸翻了鍋。

如果看到這裡你要問：什麼是JCR，那你是幸福的。你可以關掉這個視窗離開，本篇文章的內容對你一點營養都沒有。
如果你不幸剛好聽過，但是想不太起來，容我借用圖書館網頁的資料提醒你：

西文期刊排名 Journal Citation Reports on the Web(簡稱 JCR Web)，分為Science Edition及 Social Sciences Edition兩種版本。該系統收錄者為Science Citation Index Expanded及Social Sciences Citation Index兩大引文索引資料庫收錄之超過三年以上(但有部分不在此限)，由60餘個國家的3,300家出版商出版之近8,000種學術期刊，主題涵蓋約 200餘種。

也就是說SSCI期刊的impact factor (IF)分數更新了啦。

IF之於以研究混飯吃的人，就如同股價之於股民啊。所以當然大家就很關心啊。引述丹尼斯學長的話：

這就是我們這些"學術界奴工"的哀怨阿...每個人都很關心自己在做研究上的"Karma"值，即使是上升一丁點，也頗令人開心的

而某國際宅（國際化宅男）也這樣哀號：

像我JOOP被接受那年是1.91 我超開心的....結果到文章登出來時只剩下1.36（是不是好像看到某支股票連拉十根漲停板，結果等你買到手就發現股票開始反轉下跌？）。

經過一番折騰，總之平常比較常打交道的期刊IF大概都查過了。記得去年還是前年好像也寫過類似的文章，那就在這裡順便作個紀錄吧（依IF高低排序）：
AMJ 6.079       →太~恐~怖~啦～竟然破6了！
JAP 3.769
PPsyc 3.222    →喬瑟夫的心頭好，維持一貫水準
JOM 3.080      →喬瑟夫一再失利的期刊啊…唉…
ORM 3.019     →不斷竄升的新星啊！
OBHDP 2.740
JOB 2.441
JVB 2.214
GOM 2.000    →我個人跟它很不熟，但是本師門有幾位小團體學者，故此列出
JOOP 1.361   →連續兩年下跌的a+級期刊，希望可以止跌反彈，但國際宅說要等換主編比較有可能
APIR 1.177    →IF似乎較前一年略為下滑，目前喬瑟夫有一篇在1st R&R
IJSA 0.861    →喬瑟夫有兩篇文章在這裡，希望他再接再厲，向1.0邁進啊！
IJHRM 0.856  →近兩年IJSA和IJHRM感覺就像是哥倆好啊，分數都緊緊貼在一起的
JSP 0.730     →略為退步喔！希望再努力！
JASP 0.628   →本以為IJSA/IJHRM/JASP三兄弟會聯手挑戰.5保衛戰，沒想到前兩本期刊略有起色，獨留下JASP在這危險區域
JBP 0.414      →終於落到.5以下，看看新任主編可不可以救起來吧

油猴子與MyBrute

針對GreaseMonkey這個好用的firefox擴充套件，喬瑟夫已經介紹過幾次了。

今天是特別選了個主題再來促銷一次。
你也許不知道，GreaseMonkey還可以幫你玩MyBrute玩得更順手喔～
（以下所有介紹的功能都必須事先安裝GreaseMonkey）

1. My Brute Manager (MBM)
看看說明就覺得有超多變態的功能。但是因為喬瑟夫是一位熱心向學的好青年，所以大多數都還沒時間摸懂。
不過，就像九把刀說得，最精彩的就是這個不過！

除非你很閒，不然每日對戰的時候，你通常不知道對手的能力（除非之前碰過而且你還記得）。
但是在裝完MBM這個變態外掛後，在競賽大廳用滑鼠移到對手的頭像上面就可以看到對手的特殊技能、武器、是否帶著變態的寵物（參考下圖右側）。不需任何設定就可以讓你把對手看光光！個人覺得超好用的啊！熱情推薦給各位。

當然，MBM的功能遠不僅只如此。比方說，在敵人姓名上面的那些英文字是可以讓你把特定的敵人加入你的對敵清單的（用途大概是碰到肉腳角色時可以記錄下來天天欺負他吧），另外也還有多角色的帳號管理功能，這方面我也不甚瞭解，請各位摸索出來以後教我。謝謝！

2. My Brute Quick Fight (MBQF)
根據權威人士指出，每場戰鬥的勝負在點進去的那一瞬間就已經決定了。
所以如果你趕時間，基本上可以在戰鬥中點選畫面上方的banner跳回個人資料畫面、或是在點選"Start Fight"的時候快速連續多點幾次跳過。

或者，兩者都對你太麻煩的話，你可以裝上MBQF，爾後所有的戰鬥都會自動幫你跳過。
但是這樣好像很無聊…


3. My Brute List (MBL)
又一MyBrute帳號管理工具（一開始介紹的MBM也有）。如果你有很多角色待練，那你可能需要裝上MBL或MBM，它們可以幫你省下不少輸入網址的時間。


以上是今天的firefox促銷文。

喬瑟夫最近換了3.5 preview版嘗鮮，感覺在開啟有很多javascript的網頁時速度真的快了很多～
這對一個阿宅來說，不啻是讓他可以有更多的時間在往路上閒逛啊！（喂）
今天聽說3.5 rc1出來了，表示距離3.5正式版的到來又進了一步。
如果各位還沒有試過firefox，請務必嘗試看看（追求穩定的使用者可以從3.0.11版開始使用）。
當然囉，用了firefox以後也請一定要嘗試用用看greasemonkey這個好用的擴充套件！

沒重點的碎嘴雜念

參見，九把刀 - 在那之前，你該做什麼樣的事？（下）

我想很多行業的外表看起來都「好得太唬爛」了，導致很多人都無法純粹看待。

大學老師也是一樣吧…
根據喬瑟夫個人的深入觀察，很多人覺得當一位大學老師很好是因為：

1. 有寒暑假可以放
2. 有寒暑假可以放而且還有薪水
3. 就算不是放寒暑假的期間一個禮拜也只要上1x小時的課（e.g., 12~15小時/周）
4. 一個禮拜也只要上1x小時的課月薪就有5、6萬以上

其實這些都是幻覺啊～
但是我不能告訴各位真相，因為只要我一說出來生命就會遭受到嚴重的威脅，如果你真的對這份工作有興趣…

哼哼…那就先念個博士班拿個學位吧。不然可以看看這篇2005年的天下雜誌：兩萬名教授長工的故事


【後記】
這篇文章最後的模樣跟一開始寫得方向一點都不一樣啊…反正這個部落格大多數的讀者都比我有資格戳破上述幻覺，那我不寫出來也就無所謂了吧。但是這篇文章到底有什麼意思呢…嗯…我用九把刀的話來講好了（這樣才有前後呼應）：

羨慕大學老師生活的人可能誤判了自己內心的想法------他們只是喜歡放寒暑假（雖然很多大學老師在寒暑假工作的時間還是跟平常一樣多），喜歡一週只要工作十幾個小時（雖然大學老師絕對不是如此），喜歡當老師威風凜凜使喚學生的感覺（雖然大學老師絕對不是如此），但他們自己知道，這些都只是嘴砲而已。儘管他們嘴上嚷嚷著大學老師有多爽，這些人也絕對不會邁出成為大學老師的第一步的…

我也不知道我在寫什麼了…唉…

我的電腦中毒了嗎？多想五分鐘，你可以不必砍掉重練

對於不熟悉電腦的使用者來說，電腦一有任何異常，第一個反應通常是：我的電腦是不是中毒了…
雖然有時候只是網路線沒插好、或是硬碟有壞軌，但無可否認的，電腦病毒實在是讓人恨得牙癢癢的。

如果不是外行人的paranoid，而是你的防毒軟體跳出來告訴你：嘿，你的xx檔案有毒！
不知道各位通常會如何處理？我猜很多人會依照防毒軟體的建議將可疑的檔案隔離或刪除吧。

but，套用九把刀的話來說，人生最精彩的就是這個but！

防毒軟體也是會出錯的。有時候會將病毒誤判為安全的檔案，有時候則會將正常的檔案誤認為病毒。
如果誤刪了系統中重要的檔案，恭喜你，你的作業系統可能會開始鬧脾氣，你也有機會可以練習你安裝作頁系統的技能了。

如同作研究一樣，沒有一套防毒程式是完美的（太久沒在這裡談到跟研究有關的話題，今天這樣算是有擦到邊吧）。
所以我們需要triangulation，用其他的防毒軟體來補足我們電腦裡面那套防毒軟體的不足。

今天就是要跟讀者介紹兩個線上掃毒的網站，經由把檔案送交給多個防毒程式引擎判讀來幫助我們決定應該如何回應防毒軟體的警告。

這兩個網站的使用方式很類似，我就以我比較熟悉（而且速度比較快，以我自己的使用經驗來看）的VirusTotal當作範例介紹。
VirusTotal - 免費線上病毒和惡意軟體掃瞄

連上網頁後首先會看到一個上傳檔案的畫面，是的，這裡一次只能幫你檢查一個檔案。所以這樣的線上掃毒比較適合當作第二道防線，各位在自己的電腦裡面還是考慮裝套防毒軟體比較好。


選擇檔案上傳以後會看到的畫面，請勇敢的點下「顯示最新報告」：


接下來你就會看到40種防毒程式引擎對這個檔案的判讀結果。以喬瑟夫的這個例子而言，所有的防毒引擎（除我我電腦裡的CIS以外）都判斷這個檔案是安全的，因此我就放心的忽略CIS跳出的警告視窗，並且將這個檔案加入防毒軟體的白名單中（是不是跟作研究一樣，我們不應該太執著於單一研究的結論，應該是總和的來看證據力的強弱啊）。




跟這個網站類似的還有Virus.org，同樣可以上傳單一檔案給多組防毒程式引擎掃描。但不知為何，我每次連上的速度都非常的慢，所以這裡就不多作贅述了。

另外必須提醒讀者的是，這樣的作法可以幫助我們排除false positive的掃描結果，但是對於false negative（將病毒判斷為正常檔案）則是無能為力。所以使用電腦時還是要小心一點啊！

ps.會寫這篇文章是因為喬瑟夫常常會被朋友問到：欸，你來看看我的電腦是不是中毒了…我沒有那麼神，我最多也只能幫你看看防毒軟體的掃描結果，並且用這些網站重複的檢驗一下。希望這篇文章可以幫助大家自我診斷電腦問題，進而邁向光明的阿宅之路！